MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 100195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015588	GC	3	6	269	274	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
2	NC_015588	TCA	2	6	285	290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
3	NC_015588	CG	3	6	354	359	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
4	NC_015588	GTC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335561
5	NC_015588	ACG	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
6	NC_015588	GCC	2	6	499	504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335561
7	NC_015588	CCCG	2	8	547	554	0 %	0 %	25 %	75 %	334335561
8	NC_015588	AGC	2	6	561	566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
9	NC_015588	GCC	2	6	647	652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335561
10	NC_015588	GTCGCG	2	12	653	664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334335561
11	NC_015588	CTG	2	6	731	736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335561
12	NC_015588	CGTGCG	2	12	775	786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334335561
13	NC_015588	GGA	2	6	799	804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335561
14	NC_015588	TCA	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
15	NC_015588	CGACGT	2	12	871	882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335561
16	NC_015588	CTC	2	6	884	889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335561
17	NC_015588	CGA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
18	NC_015588	GGA	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335561
19	NC_015588	TTC	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334335561
20	NC_015588	CAA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335561
21	NC_015588	GTC	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335561
22	NC_015588	AGC	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
23	NC_015588	TCA	2	6	1059	1064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
24	NC_015588	GCC	2	6	1075	1080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335561
25	NC_015588	AAG	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334335561
26	NC_015588	GCG	2	6	1118	1123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335561
27	NC_015588	AGCG	2	8	1124	1131	25 %	0 %	50 %	25 %	334335561
28	NC_015588	GC	3	6	1203	1208	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
29	NC_015588	GCA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
30	NC_015588	TCA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
31	NC_015588	CGA	3	9	1294	1302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
32	NC_015588	CG	3	6	1392	1397	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
33	NC_015588	GCA	2	6	1471	1476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
34	NC_015588	CGG	2	6	1480	1485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335561
35	NC_015588	AAG	2	6	1517	1522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334335561
36	NC_015588	AGC	3	9	1590	1598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
37	NC_015588	GC	3	6	2255	2260	0 %	0 %	50 %	50 %	334335562
38	NC_015588	CGCC	3	12	2273	2284	0 %	0 %	25 %	75 %	334335562
39	NC_015588	GC	3	6	2363	2368	0 %	0 %	50 %	50 %	334335562
40	NC_015588	CCGG	2	8	2415	2422	0 %	0 %	50 %	50 %	334335562
41	NC_015588	CTC	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335562
42	NC_015588	CAA	2	6	2452	2457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335562
43	NC_015588	GCG	2	6	2502	2507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335562
44	NC_015588	GCT	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
45	NC_015588	ACGC	2	8	2603	2610	25 %	0 %	25 %	50 %	334335562
46	NC_015588	CGC	2	6	2629	2634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335562
47	NC_015588	CGA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
48	NC_015588	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
49	NC_015588	GCT	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
50	NC_015588	ACG	2	6	2805	2810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
51	NC_015588	GCG	3	9	2829	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335562
52	NC_015588	CGG	2	6	2896	2901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335562
53	NC_015588	TCG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
54	NC_015588	CCCG	2	8	2938	2945	0 %	0 %	25 %	75 %	334335562
55	NC_015588	CGACG	2	10	2962	2971	20 %	0 %	40 %	40 %	334335562
56	NC_015588	CGC	2	6	2997	3002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335562
57	NC_015588	TCG	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
58	NC_015588	CGA	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
59	NC_015588	TCC	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335562
60	NC_015588	GGAC	2	8	3207	3214	25 %	0 %	50 %	25 %	334335562
61	NC_015588	CAA	2	6	3241	3246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335562
62	NC_015588	TCG	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
63	NC_015588	CTG	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
64	NC_015588	GAC	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
65	NC_015588	GTC	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
66	NC_015588	TCG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
67	NC_015588	CAA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335563
68	NC_015588	CGG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
69	NC_015588	GGC	2	6	3544	3549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
70	NC_015588	CGT	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
71	NC_015588	CGG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
72	NC_015588	CGG	2	6	3637	3642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
73	NC_015588	CAT	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335563
74	NC_015588	GGC	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
75	NC_015588	GC	3	6	3706	3711	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
76	NC_015588	ACGTCG	2	12	3741	3752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335563
77	NC_015588	GCG	2	6	3762	3767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
78	NC_015588	TGG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335563
79	NC_015588	GCG	2	6	3804	3809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
80	NC_015588	TCG	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
81	NC_015588	ACC	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335563
82	NC_015588	CG	3	6	3867	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
83	NC_015588	AGG	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335563
84	NC_015588	GCT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
85	NC_015588	CG	3	6	4035	4040	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
86	NC_015588	CGT	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
87	NC_015588	GCT	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
88	NC_015588	CG	3	6	4079	4084	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
89	NC_015588	GAG	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335563
90	NC_015588	CGC	2	6	4105	4110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335563
91	NC_015588	CGA	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335563
92	NC_015588	CGA	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335563
93	NC_015588	CG	3	6	4210	4215	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
94	NC_015588	AGG	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335563
95	NC_015588	CAG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335563
96	NC_015588	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
97	NC_015588	GCCG	2	8	4297	4304	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
98	NC_015588	GCC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335563
99	NC_015588	CTC	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335564
100	NC_015588	TCGAGC	2	12	4422	4433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335564
101	NC_015588	TCG	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
102	NC_015588	GGGCA	2	10	4463	4472	20 %	0 %	60 %	20 %	334335564
103	NC_015588	TCG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
104	NC_015588	GC	3	6	4564	4569	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
105	NC_015588	CGT	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
106	NC_015588	GC	3	6	4591	4596	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
107	NC_015588	GC	3	6	4649	4654	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
108	NC_015588	CGGC	2	8	4756	4763	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
109	NC_015588	CTC	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335564
110	NC_015588	CGGC	2	8	4806	4813	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
111	NC_015588	CGT	2	6	4834	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
112	NC_015588	GCT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
113	NC_015588	GCG	2	6	4881	4886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335564
114	NC_015588	CGGA	2	8	4888	4895	25 %	0 %	50 %	25 %	334335564
115	NC_015588	TCG	2	6	4977	4982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
116	NC_015588	ACCG	2	8	5080	5087	25 %	0 %	25 %	50 %	334335564
117	NC_015588	GCT	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
118	NC_015588	GCC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335564
119	NC_015588	AGG	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335564
120	NC_015588	GCG	2	6	5178	5183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335564
121	NC_015588	TCG	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
122	NC_015588	CGA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335564
123	NC_015588	CTCG	2	8	5221	5228	0 %	25 %	25 %	50 %	334335564
124	NC_015588	TCGCGC	2	12	5277	5288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334335564
125	NC_015588	GCT	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
126	NC_015588	CGG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335564
127	NC_015588	CGG	2	6	5341	5346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335564
128	NC_015588	GCC	2	6	5362	5367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335564
129	NC_015588	CACGG	2	10	5399	5408	20 %	0 %	40 %	40 %	334335564
130	NC_015588	CGA	2	6	5431	5436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335564
131	NC_015588	TCG	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
132	NC_015588	GC	3	6	5495	5500	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
133	NC_015588	GCCG	2	8	5524	5531	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
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254	NC_015588	CTC	2	6	10447	10452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335568
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256	NC_015588	GAG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335568
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258	NC_015588	GAG	2	6	10582	10587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335568
259	NC_015588	TCA	2	6	10610	10615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335568
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261	NC_015588	GTC	2	6	10777	10782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335568
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263	NC_015588	TCG	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335568
264	NC_015588	GAC	2	6	10896	10901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335568
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